Treize espèces de mammifères marins vivent dans les eaux froides de la Côte. L’espèce de loup marin la plus courante, le phoque du Groenland, migre de l’Arctique à la fin de l’hiver pour mettre bas dans le Golfe du Saint-Laurent. Les glaces flottantes fournissent un habitat important aux jeunes loups marins. Baleines, marsouins et dauphins s’attroupent le long du littoral en été et en automne, attirés par l’abondance du krill et du capelan. Aujourd’hui, il y a plus de baleines au large de la Basse-Côte-Nord que partout ailleurs dans le golfe.